Akontacija dohodnine se določi na podlagi obračuna o davkih oziroma na podlagi napovedi o predvideni davčni osnovi za podjetnike v prvem letu po ustanovitvi podjetja. Akontacija se plačuje na dva načina: v obrokih 1x mesečno ali pa v obrokih 1x na 3 mesece.
Pri izračunu je treba upoštevati tudi nekatere davčne olajšave, ki jih tudi lahko uveljavljate: olajšave za invalide, za vlagatelje v raziskave, za vlagatelje, ki zaposlujejo, za vlagatelje, ki zaposlujejo invalide, za mentorje, donatorje in investitorje, olajšave za prostovoljno dodatno pokojninsko zavarovanje ipd. Podjetniki lahko uveljavljate tudi naslednje olajšave: splošno olajšavo, dodatno splošno olajšavo ter olajšavo za družinske člane, ki jih vzdržujete (otroci).
Vsak podjetnik si lahko sam plača akontacijo dohodnine. To lahko stori na naslednji način: akontacijo plača preko UPN plačilne položnice, nato pa preko spletne strani eDavki odda vse potrebne obračune.
